Вклад интегрированных и неинтегрированных свиноводческих ферм в эпидемиологическую динамику вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней (РРСС) в Италии
Репродуктивно-респираторный синдром свиней (РРСС) представляет собой значимую проблему для свиноводческой отрасли на международном уровне. Высокая генетическая изменчивость вируса РРСС (PRRSV) и низкая степень перекрёстной иммунной защиты ограничивают эффективность иммунологических методов контроля, что подчёркивает важную роль биобезопасности в управлении заболеванием. Результаты предыдущего исследования, проведённого в крупнейшей итальянской компании, осуществляющей комплексное свиноводство, показали эффективность иерархической организации потоков животных. Однако применение биостатистических методов позволило выявить потенциальные уязвимости системы, включая роль неинтегрированных хозяйств в распространении новых вариантов вируса в рамках интегрированной структуры производства. Одна из гипотез, подтверждённая результатами биостатистического и биоинформатического анализа, предполагает, что небольшие неинтегрированные фермы, расположенные в сельской местности, играют важную роль в поддержании персистенции вируса, его распространении и повторном внесении в интегрированные свиноводческие комплексы.
Целью настоящего исследования являлось подтверждение достоверности выдвинутой гипотезы путём сбора и секвенирования циркулирующих штаммов вируса в интегрированных и неинтегрированных свиноводческих хозяйствах, а также анализ паттернов и факторов, определяющих их географическое распространение на территории Италии. Данная работа раскрывает сложную сеть взаимодействий, формирующую эпидемиологическую картину РРСС в Италии. Полученные данные, основанные на секвенировании вирусных изолятов, подтверждают ранее выдвинутую гипотезу о значительной роли неинтегрированных свиноферм в поддержании персистенции и циркуляции вируса РРСС, как в пределах собственной категории, так и в качестве источника заноса вируса в интегрированные системы свиноводства. При этом отмечено также наличие менее интенсивного потока вируса в обратном направлении. Длительное существование двух независимых генетических кластеров, их постепенное распространение и периодические всплески увеличения скорости передачи свидетельствуют о низкой эффективности текущих мер контроля. Несмотря на различия в географической устойчивости и факторах риска между кластерами и категориями хозяйств, ключевыми и общими детерминантами эпидемиологического распространения оказались плотность поголовья и структура дорожной сети. Полученные результаты подчеркивают важность информационного обмена, координации действий, а также улучшения управления производством и регионального планирования для минимизации воздействия вируса РРСС и повышения эффективности его контроля.