Наука и университеты

В рамках результата “Созданы новые лаборатории, в том числе под руководством молодых перспективных исследователей”, в ФГБНУ ФИЦВиМ за период 2019–2022 гг. были основаны четыре новые лаборатории под руководством молодых кандидатов наук.

1. Лаборатория Геномики вирусов.

Лаборатория Геномики вирусов была создана в 2019 году, численность научных сотрудников в составе лаборатории – 13 человек. Руководитель структурного подразделения – Кольцова Галина Сергеевна, кандидат биологических наук, автор 60 научных работ, из которых 11 опубликовано в международных рецензируемых изданиях; дважды победитель конкурсов грантов Президента Российской Федерации и руководитель гранта РФФИ, неоднократный победитель и призер конкурсов работ молодых ученых.

Основным направлением работы лаборатории Геномики вирусов является применение геномных технологий для решения важнейших вопросов вирусологии и ветеринарии, а также разработки новых средств профилактики и лечения вирусных заболеваний животных. Лаборатория специализируется на вирусных заболеваниях животных и переносчиках, ответственных за их передачу. Основным объектом исследования являются нуклеоцитоплазматические вирусы с большой ДНК (NCLDV), такие как вирус африканской чумы свиней. В лаборатории применяются высокопроизводительные технологии секвенирования нового поколения, методы биоинформатики, молекулярной биологии и вирусологии для изучения геномной основы свойств патогена, взаимодействия хозяин-патоген, эволюции и распространения патогена. Эти знания могут быть полезны при разработке более совершенных методов мониторинга, профилактических мер, диагностики и лечения инфекционных заболеваний.

Исследовательские цели включают в себя:

• Изучение эволюции и геномной эпидемиологии патогенов.

• Изучение взаимодействий между хозяином и патогеном с использованием геномного и транскриптомного подходов.

• Определение функциональной основы вирулентности и формирования иммунного ответа.• Разработка инструментов для диагностики и профилактики вирусных заболеваний.

Публикации лаборатории за отчетный период в международных изданиях, входящих в Web of Science и Scopus:

1. Analysis of gene expression in monocytes of immunized pigs after infection with homologous or heterologous African swine fever virus/ Kholod N., Koltsov A., Koltsova G./ Front. Vet. Sci., 12 August 2022, https://doi.org/10.3389/fvets.2022.936978

2. Complete genome sequence of virulent genotype I African swine fever virus strain K49 from the Democratic Republic of the Congo, isolated from a domestic pig (Sus scrofa domesticus)./ Koltsov A, Tulman ER, Namsrayn S, Kutish GF, Koltsova G./ Arch Virol. 2022 Aug 3. doi: 10.1007/s00705-022-05543-2. Epub ahead of print. PMID: 35920982.

3. Growth Kinetics and Protective Efficacy of Attenuated ASFV Strain Congo with Deletion of the EP402 Gene/ Koltsova G., Koltsov A., Krutko S., Kholod N.,Tulman E., Kolbasov D. / Viruses 2021, 13(7), 1259; https://doi.org/10.3390/v13071259.

4. Identification and Characterization of Bluetongue Virus Serotype 14 in Russia / Koltsov A, Tsybanov S, Gogin A, Kolbasov D, Koltsova G / Front. Vet. Sci.(2020) 7:26. doi: 10.3389/fvets.2020.00026.

5. Identification of T-cell epitopes in African swine fever virus CD2v and C-type lectin proteins. Burmakina, G., Malogolovkin, A., Tulman, E.R., Xu, W., Delhon, G., Kolbasov, D., Rock, D.L. Journal of General Virology. Volume 100, Issue 2, February 2019, № 001195, Pages 259-265.

2. Лаборатория Молекулярной микробиологии

Лаборатория Молекулярной микробиологии была создана в 2019 году, списочная численность научных сотрудников – 14 человек. Руководитель структурного подразделения (в период с 2019 по 20121 гг.) – Псарева Екатерина Константиновна, кандидат биологических наук, автор 29 научных работ, из которых 6 опубликовано в международных индексируемых изданиях.

Основными направлениями исследований лаборатории являются характеризация возбудителей III-IV групп патогенности из «Государственной коллекции микроорганизмов, вызывающих опасные, особо опасные, в том числе зооантропонозные и не встречающиеся на территории страны болезни животных» ФГБНУ ФИЦВиМ и изучение эмерджентных патогенных бактерий, относящихся к группе возбудителей сапронозов. Данная деятельность направлена на установление спектра известных и новых возбудителей, в том числе, характеризующихся множественной устойчивостью к антибиотикам, которые представляют потенциальную опасность для населения России, а также могут нанести ущерб народному хозяйству, представляя опасность для сельскохозяйственных животных.

В ходе исследований в 2019-2021 гг. получены следующие результаты:

– охарактеризован спектр штаммов Listeria monocytogenes, циркулировавших на территории России в исторической перспективе и на сегодняшний день;

– показано увеличение резистентности к антимикробным препаратам у штаммов Listeria monocytogenes, выделенных в последние годы.

Сотрудники лаборатории регулярно выступают с докладами на российских («Open-Bio», 2019; «Молекулярная диагностика и безопасность», 2020; «Биосистемы: организация, поведение, управление», 2020-2021) и зарубежных научных конференциях («Epizone», 2019; «Isopol», 2019).

Активно развивается сотрудничество по подготовке высококвалифицированных кадров для науки и практики с Нижегородским государственным университетом им. Н.И. Лобачевского. Студенты бакалавриата и магистратуры по направлению «Биология» проходят практику и выполняют выпускные квалификационные работы на базе лаборатории.

Ряд сотрудников проходят обучение в аспирантуре и выполняют диссертационные работы в рамках деятельности лаборатории.

Публикации лаборатории за отчетный период:

1. Retrospective Study of Listeria Monocytogenes Isolated in the Territory of Inner Eurasia from 1947 to 1999. Pathogens. – 2019. – No. 8 (4). – Р. 184. https://doi.org/10.3390/pathogens8040184

(WoS, Q2).

2. Животные, инфицированные бактериями рода Listeria, как потенциальный источник листериоза для человека. Ветеринария. 2020. – №12. – С. 17-21.

DOI: 10.30896/0042-4846.2020.23.9.03-10 (RSCI).

3. Детекция патогенных микроорганизмов рода Listeria методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Вестник КрасГАУ. 2020. – №12. С. 117-125.

DOI: 10.36718/1819-4036-2020-12-117-125 (RSCI).

4. Antimicrobial Resistance of Listeria Monocytogenes Strains Isolated from Humans, Animals, and Food Products in Russia in 1950–1980, 2000–2005, and 2018-2021. Antibiotics 2021, 10(10), 1206; https://doi.org/10.3390/antibiotics10101206 (WoS, Q2).

5. Diversity of Listeria monocytogenes Strains Isolated from Food Products in the Central European Part of Russia in 2000–2005 and 2019–2020. Foods 2021, 10(11), 2790; https://doi.org/10.3390/foods10112790 (WoS, Q2)

3. Лаборатория Молекулярной вирусологии.

Лаборатория Молекулярной вирусологии была создана в 2022 году, списочная численность научных сотрудников – 9 человек. Руководитель структурного подразделения – Титов Илья Андреевич, кандидат биологических наук, автор 52 научных работ, из которых 17 опубликовано в международных индексируемых изданиях.

Основными направлениями исследований лаборатории являются адаптация, актуализация и совершенствование методик молекулярной диагностики вирусных болезней животных с целью улучшения их диагностических характеристик в условиях импортозамещения. Деятельность лаборатории направлена на анализ генетических последовательностей вирусных возбудителей заболеваний животных с целью выбора оптимальных целевых участков для создания высокочувствительных и высокоспецифичных диагностических тест-систем. В рамках работы лаборатории заключено соглашение о научно-техническом сотрудничестве между ФГБНУ ФИЦВиМ и Yonsei University Wonju University-Industry Foundation (YUWUIF), Корея.

4. Лаборатория Эпизоотологии и биоинформатики.

Лаборатория Эпизоотологии и биоинформатики была создана в 2022 году, списочная численность научных сотрудников – 10 человек. Руководитель структурного подразделения – Блохин Андрей Александрович, кандидат ветеринарных наук, автор 33 научных работ, из них 7 опубликовано в международных индексируемых изданиях.

Основным направлением исследований лаборатории является изучение генетических и фенотипических характеристик патогенов, факторов риска распространения инфекционных болезней животных, с последующим научным обоснованием практических подходов к эпизоотологическому мониторингу инфекционных болезней животных и актуализацией систем управления ими. Исследовательские задачи включают в себя:
-выявление новых штаммов или видов микроорганизмов и изучение их свойств;
-выявление спектра генетических детерминант, ассоциированных с патогенностью и антибиотикорезистентностью с применением современных биоинформатических подходов обработки генетических данных;
-выявление и оценка факторов риска возникновения и распространения актуальных инфекций и эффективности противоэпизоотических мероприятий;
-научное обоснование актуализации систем эпизоотологического мониторинга, систем управления рисками здоровью животных.