Разработка триплексного метода количественной ПЦР в реальном времени для выявления рекомбинантных штаммов вируса АЧС генотипов I/II
Вирус африканской чумы свиней (АЧС) вызывает высококонтагиозное и летальное геморрагическое заболевание, наносящее огромный экономический ущерб мировой свиноводческой отрасли. В последнее время в Китае и Вьетнаме были выделены и охарактеризованы летальные рекомбинантные штаммы генотипов I/II. Для дифференциации трёх генотипов вируса АЧС (I, II и I/II рекомбинантов) был разработан триплексный метод количественной ПЦР (кПЦР), нацеленный на гены B646L, A151R и MGF360-14L. Предел обнаружения для генов A151R, MGF360-14L и B646L составил 10 копий/мкл, что свидетельствует о высокой чувствительности разработанного метода. Перекрёстной реактивности с нуклеиновыми кислотами АЧС генотипов I и II, а также других вирусов свиней не наблюдалось, что подтверждает высокую специфичность метода. Коэффициент вариации не превышал 2%, что указывает на отличную воспроизводимость. Важно отметить, что при заражении поросят рекомбинантным вирусом АЧС генотипов I/II разработанный метод позволял выявлять выделение вируса уже на 3-й день после инфицирования. Таким образом, создан высокочувствительный и специфичный метод детекции, обладающий значительным потенциалом для быстрой диагностики и раннего предупреждения инфекции, вызванной рекомбинантными штаммами АЧС генотипов I/II.