Изменяющийся ландшафт африканской чумы свиней: преобразующее влияние рекомбинантного генотипа I/II на стратегии контроля в Азиатско-Тихоокеанском регионе
Появление рекомбинантных штаммов вируса африканской чумы свиней (АЧС) генотипов I/II в Азиатско-Тихоокеанском регионе представляет собой значимый сдвиг в молекулярной эпидемиологии текущей панзоотии, создавая новые вызовы для систем эпизоотологического надзора и контроля. В представленном обзорном исследовании обобщены и систематизированы данные из Китая, Вьетнама, России и Тайваня за период 2021–2025 гг., что позволило охарактеризовать ключевые аспекты эволюции и распространения рекомбинантных вариантов.
Установлено, что рекомбинантные штаммы JS/LG/21-подобной линии характеризуются стабильной химерной архитектурой генома, включающей каркас генотипа I с функциональными вставками детерминант вирулентности, типичных для генотипа II (в частности, EP402R, кодирующий белок CD2v, и гены семейств MGF_505/360). Данная геномная мозаика, по-видимому, обусловливает синергетический фенотип, проявляющийся в высокой летальности, сопоставимой с наиболее вирулентными штаммами генотипа II, и сохранении гемадсорбирующей активности (HAD⁺), что принципиально отличает эти рекомбинанты от линий генотипа I.
На основе обобщения доступных данных идентифицированы ключевые системные уязвимости, затрудняющие эффективный контроль распространения рекомбинантных штаммов. Диагностические платформы, оптимизированные преимущественно для детекции генотипа II с использованием специфических праймеров, демонстрируют ограниченную чувствительность в отношении рекомбинантных вариантов, что может приводить к их ошибочной классификации или недостаточному выявлению. Существующие вакцинные кандидаты на основе аттенуированных штаммов генотипа II не обеспечивают перекрёстной защиты против рекомбинантов I/II, что существенно ограничивает арсенал средств специфической профилактики.
Филогенетический и сравнительный геномный анализ изолятов из поражённых регионов выявил крайне высокое нуклеотидное сходство (>99,9%), что подтверждает гипотезу о монофилетическом происхождении рекомбинантной линии с последующей быстрой клональной экспансией в условиях отсутствия выраженных геномных перестроек. Вместе с тем, выявление отдельных однонуклеотидных полиморфизмов и микроделеций у изолятов из разных географических локаций указывает на продолжающиеся микроэволюционные процессы, требующие систематического мониторинга.
Полученные результаты подчёркивают настоятельную необходимость пересмотра диагностических протоколов, включая внедрение мультиплексных ПЦР-систем, способных дифференцировать генотипы I, II и рекомбинантные варианты, а также расширение использования полногеномного секвенирования для высокоразрешающего геномного надзора. Не менее важным является интеграция мониторинга популяции диких кабанов в рутинные системы эпизоотологического наблюдения, учитывая потенциальную роль дикой фауны в поддержании циркуляции вируса. Усиление политической координации и внедрение стратегий в рамках концепции «Единое здоровье» необходимы для сдерживания региональной передачи и предотвращения закрепления рекомбинантных линий вируса в новых эпизоотических нишах.
