Генетическая связь и зоны смешения влияют на распространение африканской чумы свиней в популяциях диких кабанов на северо-западе Италии
Генетические характеристики популяции-хозяина могут оказывать влияние на распространение инфекционных заболеваний в дикой природе. Однако данный фактор редко учитывается при исследовании эпизоотий. В целях выяснения возможного влияния особенностей взаимодействия популяций диких кабанов на распространение африканской чумы свиней (АЧС) на северо-западе Италии было проведено исследование генетической структуры местной популяции.
Для анализа были отобраны 578 особей диких кабанов из 26 охотничьих районов. Микросателлитное генотипирование проводилось по тринадцати локусам с использованием методов байесовской кластеризации, анализа соответствий и пространственного метода главных компонент. Параллельно с этим было изучено 2414 случаев заражения АЧС, зарегистрированных в период с декабря 2021 года по март 2025 года. Для анализа использовались методы ретроспективной пространственно-временной статистики сканирования и анализа направленного распространения.
В результате исследования были выявлены два основных генетических кластера. Один из них преимущественно соответствует региону Пьемонт, а второй — регионам Лигурии. Зоны генетического смешения наблюдаются вдоль границ этих регионов, а также существует экологический коридор через Лигурийские Апеннины, способствующий обмену генетическим материалом между кластерами.
За период в 38 месяцев было обнаружено 16 значимых кластеров АЧС. Вспышка заболевания распространилась на восток и северо-восток от первоначального очага, расположенного на границе Лигурии и Пьемонта. Четыре кластера демонстрировали значительную направленность распространения, а повторяющаяся кластеризация в определённых районах указывала на локальное сохранение вируса.
Следует отметить, что несколько кластеров АЧС совпали с зонами генетического смешения и центрами взаимодействия популяций. Это свидетельствует о том, что распространение болезни может происходить двумя основными механизмами: передачей на короткие расстояния внутри генетически родственных групп и перемещением на большие расстояния по экологическим коридорам. Включение генетического мониторинга в систему регулярного наблюдения может повысить эффективность мер по борьбе с АЧС.
