Плотность размещения поголовья и близость птицефабрик способствуют распространению высокопатогенного гриппа птиц
В последние годы были зафиксированы масштабные эпизоотии высокопатогенного гриппа птиц (ВПГП) подтипа H5. Эти вспышки привели к значительным социально-экономическим и экологическим последствиям. Распространение ВПГП среди различных видов животных и в разных географических регионах вызывает опасения относительно адаптации вируса к млекопитающим и потенциального риска возникновения пандемии среди людей. В связи с этим реализация эффективных мер по сдерживанию распространения ВПГП приобретает первостепенное значение для глобальной системы здравоохранения.
Оценка стратегий эффективного предотвращения распространения вируса между фермами требует детального анализа эпидемиологических связей между хозяйствами и выявления факторов риска. Для достижения этой цели целесообразно использовать методы филодинамического анализа, которые позволяют реконструировать генетическую эволюцию вируса и определить его пространственно-временные траектории.
Интеграция обобщенных линейных моделей (GLM) в филодинамический анализ предоставляет возможность более точно идентифицировать ключевые факторы, способствующие распространению инфекции. На основании такого комплексного подхода недавние исследования выявили значительную взаимосвязь между рядом факторов, включая географическое расположение, плотность поголовья и торговлю домашней птицей с распространением ВПГП.
В данном исследовании с целью выявления ключевых факторов, способствующих передаче вируса ВПГП H5N8 (клады 2.3.4.4b) между птицеводческими хозяйствами на юго-западе Франции в 2020–2021 годах, а также для разработки рекомендаций по оптимизации мер контроля данного вируса в регионе с высокой плотностью птицеводческих предприятий, был проведен комплексный анализ распространения инфекции с использованием филогеографических и филодинамических методов. Филодинамическое моделирование было дополнено применением обобщенных линейных моделей (GLM) для учета ряда переменных, потенциально влияющих на передачу вируса между фермами, включая производственные показатели и данные о характеристиках окружающей среды. В исследовании также использовался дополнительный набор данных, позволяющий выявить различия между действующими и неиспользуемыми птицеводческими объектами в течение рассматриваемого периода.
Результаты исследования подчеркивают значимость таких факторов, как плотность поголовья на птицеводческих предприятиях и их географическая близость, в контексте распространения вируса. В работе также представлены практические рекомендации по повышению резистентности птицеводческого сектора к вирусу высокопатогенного гриппа птиц.
