«Повышение эффективности обнаружения РНК вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней в определенных образцах биоматериала (жидкостях), хранящихся при комнатной температуре, с использованием молекулярной транспортной среды PrimeStore».
Вирус репродуктивно-респираторного синдрома свиней (РРСС) продолжает оставаться одним из наиболее значимых патогенов в свиноводческой отрасли с точки зрения экономических последствий. Наиболее востребованным методом для выявления данного вируса в образцах биоматериала остаётся ПЦР в реальном времени с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР).
В последние годы такие биоматериалы, как жидкости, получаемые из надрезанного хвоста и удалённых семенников поросят, стали более популярными для мониторинга РРСС на уровне стада. Исследования таких жидкостей, обычно собираемых в течение первой недели жизни животных, отличаются экономической эффективностью и высокой чувствительностью. Однако, как и другие типы биоматериалов, такие жидкости не являются чистыми и содержат РНК, подверженную деградации, что может приводить к ложноотрицательным и/или непоследовательным результатам при тестировании методом ОТ-ПЦР.
Для повышения эффективности обнаружения вируса РРСС методом ОТ-ПЦР, а также для улучшения значений Ct и результатов полногеномного секвенирования в данных образцах, была проведена оценка реагента PrimeStore, используемого в качестве транспортной среды (PS-MTM).
Результаты показали, что образцы, транспортированные с использованием PS-MTM, имели значительно более низкие значения Ct по сравнению с контрольными образцами. Это свидетельствует о более эффективном сохранении и выявляемости РНК вируса. Таким образом, PS-MTM может быть рекомендован для включения в протоколы отбора проб биоматериала, что позволит повысить точность мониторинга вируса РРСС и снизить количество ложноотрицательных результатов при использовании метода ОТ-ПЦР.
Результаты исследования имеют практическое значение для лабораторий и ветеринарных специалистов, занимающихся диагностикой и мониторингом вируса РРСС. Применение PS-MTM в качестве средства стабилизации РНК представляется перспективным для обеспечения безопасной и эффективной транспортировки биологических образцов, особенно в условиях полевых исследований. Тем не менее, для проведения полногеномного секвенирования с целью типирования штаммов, мониторинга мутаций и эпидемиологических исследований требуется дополнительное изучение и тщательный анализ влияния PS-MTM на целостность РНК и процессы сборки генома.
