Фрагменты генома вируса африканской чумы свиней, сходные с геномом хозяина: распределение, функции и эволюция
Все вирусные последовательности, демонстрирующие гомологию с геномом хозяина, играют важную роль в установлении взаимодействий между вирусом и клеткой хозяина, а также в патогенезе инфекции. Так, флавивирусы (Flaviviruses), включая вирусы дeнге и Зика (dengue and Zika viruses), эксплуатируют генетические мотивы, сходные с последовательностями хозяина, для модуляции иммунного ответа, что способствует вирусной репликации и развитию патологических процессов. Вирус папилломы человека (HPV), представляющий собой ДНК-содержащий вирус, использует сходство своей структуры с геномом человека для эффективного проникновения в клетку и репликации. Белки вируса, такие как E6 и E7, функционально имитируют онкосупрессорные белки человека, что приводит к нарушению регуляции клеточного цикла и повышению риска развития онкологических заболеваний. В геноме SARS-CoV-2 было идентифицировано более 100 последовательностей, демонстрирующих значительное сходство с человеческим геномом, что может свидетельствовать о возможном генетическом обмене в ходе эволюции вируса. Некоторые из таких сходных последовательностей могут участвовать в горизонтальном переносе генов, что влияет на эволюцию как бактериальных, так и фаговых геномов. Таким образом, комплексное изучение вирусно-хозяево-сходных последовательностей представляет собой важное направление исследований, направленное на понимание механизмов патогенеза вирусных инфекций, разработку антивирусных стратегий и расширение представлений о влиянии вирусов на биологию хозяина.
Вирус АЧС инфицирует представителей семейства Argasidae and suids (Аргасовых клещей и свиней). Несмотря на установленную роль вирусных последовательностей, гомологичных геному хозяина, в обеспечении выживаемости вируса, комплексные исследования геномного сходства между вирусом АЧС и его хозяевами остаются недостаточыми. В рамках настоящего исследования был проведён анализ гомологии с целью построения сети сходства между вирусом АЧС и его хозяевами (Argasidae and suids), а также для анализа распределения, функциональной роли, эволюции и возможного происхождения этих гомологичных последовательностей в геноме вируса.
Исследование выявило наличие в геномах вируса АЧС фрагментов, демонстрирующих высокую степень гомологии с последовательностями ДНК хозяев. Такое сходство свидетельствует о сложной эволюционной истории вируса, включающей возможный генетический обмен или события рекомбинации между вирусом и клетками хозяина.
Полученные данные указывают на то, что рекомбинация может выступать фактором, способствующим адаптации вируса к новым условиям и его эволюции, что может приводить к формированию штаммов с изменённой вирулентностью или расширенным спектром хозяев. Результаты подчеркивают важность рекомбинационных процессов в формировании генома вируса АЧС и вносят вклад в понимание механизмов вирусной эволюции, а также сложных взаимодействий в системе «вирус–хозяин», а также в углубление понимания механизмов вирусной эволюции и сложных процессов коэволюции вируса и его хозяина.
